Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms