Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PITX3O75364 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX3O75364 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX3O75364 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX3O75364 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PITX3O75364 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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