Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN2BO60939 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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