Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms