Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC2O43543 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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