Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms