Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APAF1O14727 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APAF1O14727 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APAF1O14727 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APAF1O14727 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APAF1O14727 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APAF1O14727 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APAF1O14727 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APAF1O14727 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APAF1O14727 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APAF1O14727 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms