Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRPO00591 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms