Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms