Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms