Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A8MVJ9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
A8MVJ9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A8MVJ9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A8MVJ9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A8MVJ9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A8MVJ9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A8MVJ9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms