Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1BA8MQ27 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms