Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms