Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD8B2A6NJW9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms