Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L4A6NCW7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms