Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IGHV3-16A0A0C4DH30 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms