Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms