Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP20Q9Y2K6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms