Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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