Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

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Length 1,222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SORCS3Q9UPU3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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