Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80Q9ULG1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms