Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms