Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNOT7Q9UIV1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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