Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms