Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP25Q9UHP3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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