Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPC1L1Q9UHC9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms