Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms