Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms