Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC6Q9UBN7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC6Q9UBN7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms