Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
REREQ9P2R6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REREQ9P2R6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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