Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms