Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
CCDC180Q9P1Z9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC180Q9P1Z9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms