Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms