Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms