Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDE1Q9NZC3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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