Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf78Q9NZ63 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf78Q9NZ63 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms