Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms