Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms