Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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