Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms