Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms