Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms