Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms