Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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