Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms