Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP2Q9BX26 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms