Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms