Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms