Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms