Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORT1Q99523 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms